民國三十七（1948）年一月建院時設置檢驗科，時由住院醫師何錫祜兼負責人。經歷75年的發展，目前檢驗醫學科獲得“浙江省工人先鋒號、省市共建重點醫學學科、衢州市醫學重點學科、衢州市高技能人才創新工作室、市青年文明號、衢州市抗擊新冠肺炎疫情先進集體”等榮譽稱號，市臨床檢驗質控中心掛靠單位，設有俞云松教授專家工作站。

檢驗醫學科現有員工69人，擁有高級職稱17人，博士2人，碩士17人。開設臨床血液、體液檢驗、臨床生化檢驗、臨床免疫檢驗、臨床微生物檢驗、臨床分子遺傳學等亞專業學科，集臨床檢驗、教學、健康體檢、醫療器械GCP試驗、實驗室診斷技術研發等服務于一體。開展檢驗項目500余項，年完成檢驗樣本300余萬份。

檢驗醫學科專業基地現有配置有Sysmex全自動血液分析流水線、流式細胞儀、骨髓圖像報告系統。急診生化免疫分析儀、全自動尿液分析流水線、Stago全自動凝血分析流水線、Abbott GLP-1全自動生化免疫流水線、BD自動血培養儀、BD結核桿菌快速液體培養儀、自動細菌鑒定藥敏系統、BD MALDI-TOF質譜儀、自動酶免分析儀、數十套熒光PCR儀等高精尖檢驗專業設備。其中Abbott GLP-1全自動生化免疫流水線為亞太地區規模最大。

2012年取得浙江省檢驗醫師規范化培訓專業基地資格，現為國家住院醫師規范化培訓檢驗醫學科專業基地，是四省邊際周邊地市唯一檢驗醫學科專業住培基地。專業基地清潔區設有示教室、自學教室、可連接內網與外網的電腦機房，醫院數字化圖書館有專業中英文數據檢索平臺等。2021年開設檢驗醫學?？崎T診，為患者提供實驗室檢測服務、結果解釋和咨詢服務，參與臨床MDT等。

檢驗科數年來參加衛生部和浙江省臨檢中心各項室間質評項目成績均為合格（優秀）。連續多年獲浙江省檢驗科質量和安全實地考核優秀單位。